服务器+高斯软件+超算

boyanx2周前技术教程6

有朋友买了Dell服务器,拜托我配置一下。现把过程总结一下,留待以后查看。

Dell服务器,8核处理器,16G内存,做高斯计算这配置还可以。 来的是个裸机,找计算中心杨老师借了win10优盘,插进去,自动安装win10,一路默认安装,不到半小时这个原版win10就安装好了。再安装360杀毒软件,安装高斯09。注意,安装高斯软件不要用任何中文,不论安装目录还是使用人,公司啥的。虽然高斯软件最好再centos下运行,但反正单用户自用,win版本的操作更加简单。

高斯输入文件头几项应该这么设置:%nprocshare =4(不知道为啥,命名8核,却只能写4核,写5以上全部出错,最后CPU利用率是50%)。%mem不能设置,不然会出错,也不知道为啥。%chk设置为和输入文件名字一致即可。 操作注意:file-->open打开输入文件,file--modify可以设置输入文件。设置好后,点击run即可运行计算。正中间的3个小黄点的按钮是批处理按钮,batchdata是批处理操作,可以把输入文件都设置好,通过batchdata加入进去,然后就能一个接一个自动计算。 一个分子计算大概7个多小时,速度还是挺快的。最后形成out文件和chk文件(chk文件在scratch文件夹中)。out文件可以用写字板查看内容,chk文件需要用utilities-->formchk转化为fchk文件,然后用高斯view打开就能查看计算结果。

超算服务是齐大计算中心提供的,申请账号和密码,再下载安装xshell软件就能登陆。常用命令如下:1、pbsnodes 显示所有节点;2、cd 转换目录;3、ls 显示节点下所有的文件夹;4、ssh 链接节点,就能在这个节点上进行计算操作。(这个比较有用,比如用pbsnodes查看有哪些节点,然后用ssh链接上某个节点就能进行在这个节点进行操作了。我一般链接gpu02。命令如:ssh gpu02)5、ps aux 看运行哪些线程6、nohup python3 –u *.py >myout.txt 2>&1 & 不间断的运行py文件7、kill8.rz 会弹出文件选择框,上传文件(这个也比较有用,把py文件或者gjf文件上传到服务器你自己目录下,然后进行运行)9.sz下载10.rm –ir 删除文件11.rm –if 删除文件夹12. mkdir test创建文件夹13.pwd 查看当前实际目录就用了一些常用命令,怎么安装软件还不会,更别说利用它计算了。

超算服务器没有安装高斯软件,而且我在网上也找不到centos版本的高斯软件。这个超算服务器算是没啥用了。

标签: js 上传文件

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